Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15,17■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,12■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15,11■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,1■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15,1■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,09■□□□□ 0,01
5730596B20RikQ8BQ08 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15,08■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15,08■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15,07■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15,07■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,5 ms