Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan12Q8BKT6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan12Q8BKT6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan12Q8BKT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan12Q8BKT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan12Q8BKT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms