Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJI4

Pou6f2, POU domain, class 6, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f2Q8BJI4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou6f2Q8BJI4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou6f2Q8BJI4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou6f2Q8BJI4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou6f2Q8BJI4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f2Q8BJI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f2Q8BJI4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou6f2Q8BJI4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms