Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim19Q80ZU4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim19Q80ZU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim19Q80ZU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms