Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ell3Q80VR2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ell3Q80VR2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ell3Q80VR2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms