Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp8Q80U87 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp8Q80U87 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp8Q80U87 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp8Q80U87 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp8Q80U87 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms