Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Avl9Q80U56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Avl9Q80U56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Avl9Q80U56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Avl9Q80U56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Avl9Q80U56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms