Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccp110Q7TSH4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccp110Q7TSH4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccp110Q7TSH4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms