Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4b1Q7TS58 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4b1Q7TS58 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clec4b1Q7TS58 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec4b1Q7TS58 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4b1Q7TS58 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4b1Q7TS58 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4b1Q7TS58 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4b1Q7TS58 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clec4b1Q7TS58 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms