Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn1Q7TPR4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn1Q7TPR4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Actn1Q7TPR4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Actn1Q7TPR4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actn1Q7TPR4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms