Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HhipQ7TN16 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HhipQ7TN16 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HhipQ7TN16 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HhipQ7TN16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms