Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sys1Q78S06 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sys1Q78S06 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sys1Q78S06 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms