Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssh1Q76I79 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssh1Q76I79 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ssh1Q76I79 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ssh1Q76I79 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms