Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Zc3h4Q6ZPZ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zc3h4Q6ZPZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zc3h4Q6ZPZ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms