Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp2b4Q6Q477 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b4Q6Q477 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp2b4Q6Q477 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp2b4Q6Q477 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp2b4Q6Q477 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms