Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a2Q6PIE5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp1a2Q6PIE5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1a2Q6PIE5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a2Q6PIE5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms