Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnip4Q6PHZ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms