Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasa4Q6PFQ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasa4Q6PFQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasa4Q6PFQ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rasa4Q6PFQ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rasa4Q6PFQ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rasa4Q6PFQ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rasa4Q6PFQ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rasa4Q6PFQ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms