Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fhod1Q6P9Q4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fhod1Q6P9Q4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fhod1Q6P9Q4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fhod1Q6P9Q4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fhod1Q6P9Q4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fhod1Q6P9Q4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fhod1Q6P9Q4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms