Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp49Q6P9L4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp49Q6P9L4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp49Q6P9L4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp49Q6P9L4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms