Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cpa4Q6P8K8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cpa4Q6P8K8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpa4Q6P8K8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms