Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd5Q6P5H6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd5Q6P5H6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd5Q6P5H6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd5Q6P5H6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd5Q6P5H6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd5Q6P5H6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd5Q6P5H6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd5Q6P5H6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd5Q6P5H6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd5Q6P5H6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd5Q6P5H6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms