Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2surpQ6NV83 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2surpQ6NV83 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
U2surpQ6NV83 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2surpQ6NV83 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2surpQ6NV83 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms