Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2810408A11RikQ6NSU2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2810408A11RikQ6NSU2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms