Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud6aQ6IE21 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Otud6aQ6IE21 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud6aQ6IE21 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms