Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScapQ6GQT6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScapQ6GQT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ScapQ6GQT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ScapQ6GQT6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms