Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp11bQ6DFW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp11bQ6DFW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp11bQ6DFW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp11bQ6DFW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp11bQ6DFW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms