Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmcc1Q69ZZ6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc1Q69ZZ6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms