Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BegainQ68EF6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BegainQ68EF6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BegainQ68EF6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BegainQ68EF6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms