Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp4aQ64436 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp4aQ64436 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp4aQ64436 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp4aQ64436 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms