Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf4Q64310 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Surf4Q64310 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms