Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf1Q64213 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf1Q64213 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf1Q64213 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf1Q64213 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf1Q64213 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf1Q64213 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf1Q64213 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf1Q64213 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf1Q64213 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms