Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr2kQ63871 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2kQ63871 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms