Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndrg1Q62433 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndrg1Q62433 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndrg1Q62433 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndrg1Q62433 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndrg1Q62433 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms