Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpd52Q62393 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpd52Q62393 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpd52Q62393 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpd52Q62393 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms