Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TrhQ62361 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TrhQ62361 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TrhQ62361 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TrhQ62361 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TrhQ62361 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TrhQ62361 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TrhQ62361 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TrhQ62361 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TrhQ62361 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TrhQ62361 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TrhQ62361 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TrhQ62361 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TrhQ62361 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TrhQ62361 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TrhQ62361 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TrhQ62361 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TrhQ62361 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TrhQ62361 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms