Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssr4Q62186 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr4Q62186 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssr4Q62186 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr4Q62186 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms