Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RhocQ62159 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RhocQ62159 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RhocQ62159 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhocQ62159 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RhocQ62159 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RhocQ62159 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RhocQ62159 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RhocQ62159 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhocQ62159 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhocQ62159 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RhocQ62159 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RhocQ62159 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms