Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AlcamQ61490 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlcamQ61490 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AlcamQ61490 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AlcamQ61490 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms