Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf235Q61116 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf235Q61116 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf235Q61116 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf235Q61116 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf235Q61116 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms