Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sim1Q61045 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sim1Q61045 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sim1Q61045 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms