Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift20Q61025 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift20Q61025 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift20Q61025 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms