Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HellsQ60848 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HellsQ60848 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HellsQ60848 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HellsQ60848 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HellsQ60848 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HellsQ60848 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HellsQ60848 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HellsQ60848 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HellsQ60848 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HellsQ60848 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms