Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf8Q60846 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf8Q60846 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms