Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Satb1Q60611 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Satb1Q60611 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Satb1Q60611 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms