Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sco1Q5SUC9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sco1Q5SUC9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sco1Q5SUC9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sco1Q5SUC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms