Protein–RNA interactions for Protein: Q5SU73

Coil, Coilin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoilQ5SU73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
CoilQ5SU73 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
CoilQ5SU73 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
CoilQ5SU73 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
CoilQ5SU73 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
CoilQ5SU73 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28,8■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28,78■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,77■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28,77■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
CoilQ5SU73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28,71■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
CoilQ5SU73 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,65■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,64■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
CoilQ5SU73 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28,63■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,62■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,62■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28,58■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,58■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
CoilQ5SU73 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CoilQ5SU73 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
CoilQ5SU73 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CoilQ5SU73 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CoilQ5SU73 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CoilQ5SU73 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CoilQ5SU73 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CoilQ5SU73 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,6 ms