Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms