Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zdbf2Q5SS00 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zdbf2Q5SS00 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zdbf2Q5SS00 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zdbf2Q5SS00 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zdbf2Q5SS00 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms