Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc88aQ5SNZ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc88aQ5SNZ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88aQ5SNZ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms